Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SERINC4A6NH21 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms