Protein–RNA interactions for Protein: U3KPV4

A3GALT2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3GALT2U3KPV4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3GALT2U3KPV4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
A3GALT2U3KPV4 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
A3GALT2U3KPV4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
A3GALT2U3KPV4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms