Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H6

KCNE3, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNE3Q9Y6H6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCNE3Q9Y6H6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNE3Q9Y6H6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNE3Q9Y6H6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms