Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G0

PCDHGB5, Protocadherin gamma-B5, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB5Q9Y5G0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PCDHGB5Q9Y5G0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCDHGB5Q9Y5G0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCDHGB5Q9Y5G0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms