Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQB3

CTNND2, Catenin delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNND2Q9UQB3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CTNND2Q9UQB3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CTNND2Q9UQB3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CTNND2Q9UQB3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CTNND2Q9UQB3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CTNND2Q9UQB3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms