Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN72

PCDHA7, Protocadherin alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA7Q9UN72 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PCDHA7Q9UN72 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA7Q9UN72 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA7Q9UN72 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA7Q9UN72 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms