Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULM2

ZNF490, Zinc finger protein 490, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF490Q9ULM2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ZNF490Q9ULM2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNF490Q9ULM2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNF490Q9ULM2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms