Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK00

C3orf18, Uncharacterized protein C3orf18, humanhuman

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf18Q9UK00 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C3orf18Q9UK00 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C3orf18Q9UK00 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C3orf18Q9UK00 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C3orf18Q9UK00 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms