Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ4

SALL4, Sal-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL4Q9UJQ4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SALL4Q9UJQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SALL4Q9UJQ4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.72
SALL4Q9UJQ4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SALL4Q9UJQ4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms