Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIY3

RWDD2A, RWD domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RWDD2AQ9UIY3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RWDD2AQ9UIY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RWDD2AQ9UIY3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RWDD2AQ9UIY3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RWDD2AQ9UIY3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms