Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN6

TNFRSF10D, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10D, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF10DQ9UBN6 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TNFRSF10DQ9UBN6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TNFRSF10DQ9UBN6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNFRSF10DQ9UBN6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNFRSF10DQ9UBN6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms