Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SH3BP4Q9P0V3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SH3BP4Q9P0V3 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SH3BP4Q9P0V3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4Q9P0V3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4Q9P0V3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4Q9P0V3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4Q9P0V3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SH3BP4Q9P0V3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms