Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0M6

H2AFY2, Core histone macro-H2A.2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFY2Q9P0M6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
H2AFY2Q9P0M6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
H2AFY2Q9P0M6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
H2AFY2Q9P0M6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
H2AFY2Q9P0M6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms