Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MYOFQ9NZM1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MYOFQ9NZM1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.6
MYOFQ9NZM1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYOFQ9NZM1 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms