Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
VNN3Q9NY84 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VNN3Q9NY84 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VNN3Q9NY84 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.8 ms