Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY61

AATF, Protein AATF, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AATFQ9NY61 TSSC2-206ENST00000533775 1210 ntTSL 523.81■■□□□ 1.44e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-235ENST00000530848 688 ntTSL 323.68■■□□□ 1.384e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 422.81■■□□□ 1.244e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.224e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.194e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-249ENST00000533749 633 ntTSL 521.49■■□□□ 1.034e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 521.4■■□□□ 1.024e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.014e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-224ENST00000529007 861 ntTSL 221.12■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-206ENST00000524397 957 ntTSL 321.12■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.974e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-237ENST00000531281 813 ntTSL 221.04■□□□□ 0.964e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.914e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-250ENST00000533833 831 ntTSL 520.56■□□□□ 0.884e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-208ENST00000448874 1108 ntTSL 220.41■□□□□ 0.866e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-212ENST00000481928 1635 ntTSL 320.1■□□□□ 0.816e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-244ENST00000532543 791 ntTSL 319.84■□□□□ 0.774e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 TSSC2-202ENST00000526284 1244 ntTSL 1 (best)19.35■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.674e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-239ENST00000531670 926 ntTSL 318.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 218.93■□□□□ 0.624e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-230ENST00000530191 853 ntTSL 318.76■□□□□ 0.594e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-251ENST00000534232 817 ntTSL 518.39■□□□□ 0.534e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 418.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 218.13■□□□□ 0.494e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-252ENST00000534377 617 ntTSL 218.02■□□□□ 0.484e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.464e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.394e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-247ENST00000533204 842 ntTSL 216.84■□□□□ 0.294e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 416.7■□□□□ 0.264e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-253ENST00000534380 1001 ntTSL 516.61■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-236ENST00000531218 787 ntTSL 316.61■□□□□ 0.254e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-215ENST00000526340 770 ntTSL 316.37■□□□□ 0.214e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-211ENST00000468027 621 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.126e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 415.79■□□□□ 0.124e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-248ENST00000533494 758 ntTSL 515.61■□□□□ 0.094e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 415.34■□□□□ 0.054e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-242ENST00000531953 506 ntTSL 415.18■□□□□ 0.024e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 TSSC2-203ENST00000526488 674 ntTSL 314.8□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-209ENST00000466801 784 ntTSL 513.16□□□□□ -0.36e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-204ENST00000409683 933 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.366e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-203ENST00000409321 735 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.46e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-201ENST00000341369 1212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.456e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-213ENST00000526133 367 ntTSL 212.14□□□□□ -0.474e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 PTMA-202ENST00000409115 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.536e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-226ENST00000529516 473 ntTSL 311.08□□□□□ -0.644e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 410.28□□□□□ -0.764e-6■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.038e-7■■■■■ 39.5
AATFQ9NY61 SEPT2-211ENST00000421717 818 ntTSL 421.47■■□□□ 1.031e-10■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 SEPT2-225ENST00000457874 484 ntTSL 37.53□□□□□ -1.21e-10■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 SEPT2-222ENST00000449239 599 ntTSL 25.92□□□□□ -1.461e-10■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 SEPT2-236ENST00000476841 304 ntTSL 35.27□□□□□ -1.571e-10■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 SEPT2-239ENST00000484167 668 ntTSL 24.59□□□□□ -1.671e-10■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.381e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-212ENST00000612489 804 ntTSL 522.52■■□□□ 1.21e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-217ENST00000619129 2020 ntTSL 222.43■■□□□ 1.181e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.181e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-216ENST00000618252 1147 ntTSL 521.67■■□□□ 1.061e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-213ENST00000613181 1373 ntTSL 221.31■■□□□ 11e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.61e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.531e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-210ENST00000531154 1930 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.621e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 ALG9-209ENST00000530851 692 ntTSL 510.07□□□□□ -0.81e-16■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.474e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.054e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 NCOR2-207ENST00000420698 1752 ntTSL 218.53■□□□□ 0.562e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 NCOR2-212ENST00000448008 735 ntTSL 516.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 NCOR2-224ENST00000542927 828 ntTSL 315.13■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 THRAP3-203ENST00000469141 3339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.044e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 THRAP3-201ENST00000354618 4432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.374e-6■■■■■ 39.1
AATFQ9NY61 CCDC57-214ENST00000582040 330 ntTSL 317.66■□□□□ 0.421e-6■■■■■ 39
AATFQ9NY61 CCDC57-207ENST00000419322 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 517.08■□□□□ 0.331e-6■■■■■ 39
AATFQ9NY61 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 39
AATFQ9NY61 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -01e-6■■■■■ 39
AATFQ9NY61 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-6■■■■■ 39
AATFQ9NY61 EIF4G2-218ENST00000531416 1969 ntTSL 218.97■□□□□ 0.634e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-232ENST00000640650 2724 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.644e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-201ENST00000339995 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-225ENST00000532383 6769 ntTSL 1 (best)10.57□□□□□ -0.724e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-202ENST00000396525 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.984e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-205ENST00000525681 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.69□□□□□ -1.024e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-208ENST00000526148 4001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.134e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-215ENST00000530564 849 ntTSL 25.22□□□□□ -1.574e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.31□□□□□ -2.044e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 EIF4G2-222ENST00000532120 223 ntTSL 31.14□□□□□ -2.234e-31■■■■■ 38.9
AATFQ9NY61 ZFAS1-207ENST00000458653 596 ntTSL 234.5■■■■□ 3.117e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-202ENST00000371743 1008 ntTSL 1 (best)30.8■■■□□ 2.527e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-203ENST00000417721 860 ntTSL 1 (best)29.57■■■□□ 2.327e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.817e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-205ENST00000441722 946 ntTSL 1 (best)26.36■■□□□ 1.817e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-209ENST00000620594 508 ntTSL 39.44□□□□□ -0.97e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-204ENST00000428008 566 ntTSL 28.91□□□□□ -0.987e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 ZFAS1-201ENST00000326677 504 ntTSL 1 (best)8.91□□□□□ -0.987e-52■■■■■ 38.8
AATFQ9NY61 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.397e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.217e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.777e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.427e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.297e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 TMEM91-206ENST00000447302 721 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.047e-8■■■■■ 38.4
AATFQ9NY61 TMEM91-208ENST00000537354 450 ntTSL 314.14□□□□□ -0.157e-8■■■■■ 38.4
Retrieved 100 of 5,565 protein–RNA pairs in 36.6 ms