Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1orf109Q9NX04 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1orf109Q9NX04 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C1orf109Q9NX04 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C1orf109Q9NX04 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms