Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWT1

PAK1IP1, p21-activated protein kinase-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAK1IP1Q9NWT1 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PAK1IP1Q9NWT1 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PAK1IP1Q9NWT1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PAK1IP1Q9NWT1 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms