Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATAD3AQ9NVI7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATAD3AQ9NVI7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATAD3AQ9NVI7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms