Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SH2B1Q9NRF2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SH2B1Q9NRF2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
SH2B1Q9NRF2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SH2B1Q9NRF2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SH2B1Q9NRF2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms