Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PFDN4Q9NQP4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PFDN4Q9NQP4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PFDN4Q9NQP4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.9 ms