Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NRIP3Q9NQ35 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRIP3Q9NQ35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NRIP3Q9NQ35 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
NRIP3Q9NQ35 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms