Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI7

KRCC1, Lysine-rich coiled-coil protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRCC1Q9NPI7 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KRCC1Q9NPI7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KRCC1Q9NPI7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
KRCC1Q9NPI7 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
KRCC1Q9NPI7 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms