Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM4

EPB41L5, Band 4.1-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L5Q9HCM4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPB41L5Q9HCM4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPB41L5Q9HCM4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
EPB41L5Q9HCM4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
EPB41L5Q9HCM4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms