Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB63

NTN4, Netrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTN4Q9HB63 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NTN4Q9HB63 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NTN4Q9HB63 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NTN4Q9HB63 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NTN4Q9HB63 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms