Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAK2

EBF2, Transcription factor COE2, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF2Q9HAK2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EBF2Q9HAK2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EBF2Q9HAK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EBF2Q9HAK2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms