Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIN28AQ9H9Z2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIN28AQ9H9Z2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIN28AQ9H9Z2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms