Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COG4Q9H9E3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COG4Q9H9E3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
COG4Q9H9E3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms