Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6D8

FNDC4, Fibronectin type III domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC4Q9H6D8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
FNDC4Q9H6D8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
FNDC4Q9H6D8 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
FNDC4Q9H6D8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms