Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4K1

RIBC2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIBC2Q9H4K1 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RIBC2Q9H4K1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RIBC2Q9H4K1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RIBC2Q9H4K1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms