Protein–RNA interactions for Protein: Q9H320

VCX, Variable charge X-linked protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCXQ9H320 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
VCXQ9H320 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
VCXQ9H320 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
VCXQ9H320 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCXQ9H320 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.2 ms