Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNMDQ9H2S6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
TNMDQ9H2S6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TNMDQ9H2S6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TNMDQ9H2S6 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms