Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0Z9

RBM38, RNA-binding protein 38, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM38Q9H0Z9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBM38Q9H0Z9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBM38Q9H0Z9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RBM38Q9H0Z9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
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