Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRIM15Q9C019 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM15Q9C019 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM15Q9C019 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms