Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZY9

TRIM31, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM31, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM31Q9BZY9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TRIM31Q9BZY9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM31Q9BZY9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM31Q9BZY9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM31Q9BZY9 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM31Q9BZY9 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM31Q9BZY9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM31Q9BZY9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms