Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM8Q9BZR9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TRIM8Q9BZR9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRIM8Q9BZR9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms