Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C1QTNF3Q9BXJ4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1QTNF3Q9BXJ4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C1QTNF3Q9BXJ4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms