Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX67

JAM3, Junctional adhesion molecule C, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM3Q9BX67 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
JAM3Q9BX67 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
JAM3Q9BX67 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
JAM3Q9BX67 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms