Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUN5

CCDC28B, Coiled-coil domain-containing protein 28B, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC28BQ9BUN5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC28BQ9BUN5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CCDC28BQ9BUN5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CCDC28BQ9BUN5 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms