Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTT6

LRRC1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC1Q9BTT6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
LRRC1Q9BTT6 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
LRRC1Q9BTT6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRRC1Q9BTT6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.3 ms