Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SEC22CQ9BRL7 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SEC22CQ9BRL7 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SEC22CQ9BRL7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms