Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
BPIFA3Q9BQP9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
BPIFA3Q9BQP9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
BPIFA3Q9BQP9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
BPIFA3Q9BQP9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms