Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQE3

TUBA1C, Tubulin alpha-1C chain, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA1CQ9BQE3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TUBA1CQ9BQE3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TUBA1CQ9BQE3 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TUBA1CQ9BQE3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TUBA1CQ9BQE3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms