Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CTAGE1Q96RT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CTAGE1Q96RT6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CTAGE1Q96RT6 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
CTAGE1Q96RT6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 253.4 ms