Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLIC6Q96NY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CLIC6Q96NY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CLIC6Q96NY7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms