Protein–RNA interactions for Protein: Q96NA2

RILP, Rab-interacting lysosomal protein, humanhuman

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RILPQ96NA2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RILPQ96NA2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RILPQ96NA2 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RILPQ96NA2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms