Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW7

TIGD1, Tigger transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIGD1Q96MW7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TIGD1Q96MW7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TIGD1Q96MW7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
TIGD1Q96MW7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TIGD1Q96MW7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms