Protein–RNA interactions for Protein: Q96HH6

TMEM19, Transmembrane protein 19, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM19Q96HH6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
TMEM19Q96HH6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMEM19Q96HH6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TMEM19Q96HH6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TMEM19Q96HH6 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms