Protein–RNA interactions for Protein: Q96GZ6

SLC41A3, Solute carrier family 41 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A3Q96GZ6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC41A3Q96GZ6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC41A3Q96GZ6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC41A3Q96GZ6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC41A3Q96GZ6 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms