Protein–RNA interactions for Protein: Q96EH3

MALSU1, Mitochondrial assembly of ribosomal large subunit protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MALSU1Q96EH3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
MALSU1Q96EH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MALSU1Q96EH3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MALSU1Q96EH3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms